Αρνητικό είναι το συμπέρασμα της πραγματογνωμοσύνης του Εθνικού Μετσόβιου Πολυτεχνείου, που εξέτασε για λογαριασμό της Πυροσβεστικής τα υπολείμματα (κομμάτια του πιλοτηρίου και τα πλαίσια της ηλεκτρομηχανής) προκειμένου να αποφανθεί αν είχαν σημάδια από φωτιά (έκρηξη) ή μόνον από χτυπήματα λόγω της σύγκρουσης.
Σύμφωνα με πληροφορίες, ο καθηγητής του Πολυτεχνείου που ανέλαβε την έρευνα, Πέτρος Τσακιρίδης, παρέδωσε στον εφέτη ανακριτή Σωτήρη Μπακαΐμη την πραγματογνωμοσύνη του και σύμφωνα με το συμπέρασμά του από την αυτοψία στο Κουλούρι που έγινε από την αρμόδια υπηρεσία (ΔΑΕ) της Πυροσβεστικής, ο πραγματογνώμονας καθηγητής του ΕΜΠ καταλήγει πως τα κομμάτια του πιλοτηρίου και τα πλαίσια της ηλεκτρομηχανής που εξετάστηκαν και τα δείγματα που ελήφθησαν, οδηγούν στο συμπέρασμα ότι δεν είναι καμένα, δεν δηλώνουν δηλαδή έκρηξη, αλλά φέρουν μόνον παραμορφώσεις από χτυπήματα που προκλήθηκαν από τη σύγκρουση των τρένων.
Αξίζει να σημειωθεί ότι και για το πόρισμα αυτό έχουν λάβει γνώση τόσο οι κατηγορούμενοι, όσο και οι δικηγόροι των συγγενών των θυμάτων, καθώς αποτελεί πλέον σώμα της δικογραφίας που έχει σχηματιστεί στο πλαίσιο της έρευνας του εφέτη ειδικού ανακριτή Σωτήρη Μπακαΐμη.